Том самоуверен и вряд ли допускает мысль о том, что Филлис может скрывать от него что-то действительно серьезное. Точно так же Волдеморт в свое время до последнего не подозревал Расальхаг. А Филлис сложно. С одной стороны, она от необходимости постоянно притворяться уже устала, с другой - свести дружбу на нет не может, потому что считает, что может своим присутствием в жизни Тома как-то его контролировать. Так что действительно сложно все у них.

О магическом всплеске вследствие использования хроноворота Гермионе Макгонагалл рассказала, не Помфри, так что никакой медицинской рекомендации в этом нет. Помфри только констатировала факт потери магии, лечения она предложить не может. А Гермионе совсем не выгодно кому-то объяснять, что нападение василиска имеет свои последствия.
О рабстве домовиков Гермиона на нервах заговорила. На нее такое свалилось, а Гарри о своем наследстве рассуждает, весь из себя радостный.
Не знаю, насколько Том в силах ей помочь "вот прям сейчас", но Гермиона уже не может все это держать в себе плюс время поджимает.

В Хогвартсе существует взаимный обмен магической энергией, тут нет исключительно дающей или исключительно потребляющей стороны. Гермиона вследствие связи с василиском баланс для себя нарушила, поэтому теряет способность быть проводником этой энергии. Вот почему в западном квартале с большой осторожностью относятся к колдовству возле круга и другим способам контактировать с существами, магия которых отлична от человеческой.

Джереми попал в Хогвартс, потому что Конни знает о том, что скрывает Пернелла, и думает, что может ее шантажировать. Вторым Мерлином ему, конечно, не стать, но Пернелла его недооценивает. А Табита да, на пороге удивительных открытий в жизни)))

Да, про Вивиан и мальчика из Дурмстранга все верно.