Calmius
Ну если вы далеки от микробиологии, то что вам советовать? А вы далеки, иначе этот путь метаболизма вспомнили бы сразу. Ну начните с https://cyberleninka.ru/article/n/poluchenie-vodoroda-biologicheskim-putem/viewer
Клостридии это любят (эти милые существа много чего любят). Но процесс выделения водорода, насколько я знаю, сильно подавляется водородом, поэтому такие сообщества активно растут, только если есть возможность куда-то сбрасывать водород. Тут-то на сцену выходят археи и окисляют его до метана и воды. На метан всем начхать, и он невозбранно накапливается.