Так никто и не уравнивает одного мага с целой цивилизацией.
По уровню комфорта, по силе менять окружающую среду, по военной мощи один маг в среднем равен скорее магловскому клану, деревне, максимум - греческому полису.

Примерно на этом уровне маги и застряли - "а большего нам и не нужно".
В древности один шаман - на каждое племя, в античности семья магов (полдюжины) на феодальное княжество.
Бледное подобие министерства и государства у магов образовалось только в средние века, когда раздробленная европа превращалась в крепкие Империи.

PS Кстати по этой логике свой аналог (Министерства Магии) должен был быть у Римской Империи, Античного Китая и др.